Comparative evaluation under routine conditions of the nitrate reduction assay, the proportion assay and the MGIT 960 assay for drug susceptibility testing of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis

The performance of the nitrate reductase assay (NRA) was compared with the proportion method (PM) on Lowenstein-Jensen medium and the BACTEC MGIT960 assay under routine conditions using 160 clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis with a high proportion of resistant strains. The mean time to obtain results was 8.8 days and the overall agreements between NRA and PM and NRA and M960 were 95 percent and 94 percent, respectively. NRA was easy to perform and represents a useful tool for the rapid screening of drug-resistant M. tuberculosis strains in low-resource countries.

Identificação de Mycobacterium bovis em cepas micobacterianas isoladas espécimes clínicos humanos em um complexo hospitalar na cidade do Rio de Janeiro / Identification of Mycobacterium bovis among mycobacterial isolates from human clinical specimens at a university hospital in Rio de Janeiro, Brazil

Entre 2005 e 2006, 8.121 espécimes clínicos enviados ao Laboratório de Micobactérias do Hospital Universitário Clementino Fraga Filho/Instituto de Doenças do Tórax, no Rio de Janeiro, RJ, foram inoculados em meio Löwenstein-Jensen contendo glicerol e piruvato. Desses espécimes, 79 isolados de micobactérias tiveram crescimento somente em meio com piruvato, sendo selecionados para a identificação presuntiva de Mycobacterium bovis. Esses isolados foram submetidos à identificação por testes bioquímicos, amplificação por PCR com primers específicos (Rv0577 e Rv1510) e teste de suscetibilidade à pirazinamida. Todas as cepas apresentaram padrões fenotípicos e genotípicos de M. tuberculosis, não sendo detectado M. bovis.

In 2005 and 2006, 8,121 clinical specimens submitted to the Mycobacteriology Laboratory of the Clementino Fraga Filho University Hospital/Thoracic Diseases Institute, in the city of Rio de Janeiro, Brazil, were inoculated on Löwenstein-Jensen medium containing glycerol and pyruvate. There were 79 mycobacteria isolates that presented growth only on pyruvate-containing medium, and those isolates were selected for the presumptive identification of Mycobacterium bovis. The selected isolates were screened with biochemical tests, PCR amplification (with the specific primers Rv0577 and Rv1510), and pyrazinamide susceptibility tests. All of the strains isolated showed specific phenotypical and genotypical patterns characteristic of M. tuberculosis, and no M. bovis strains were detected.

Identificação de micobactérias não tuberculosas isoladas de sítios estéreis em pacientes em um hospital universitário na cidade do Rio de Janeiro / Identification of nontuberculous mycobacteria isolated from clinical sterile sites in patients at a university hospital in the city of Rio de Janeiro, Brazil

OBJETIVO: Identificar micobactérias não tuberculosas (MNT) isoladas de sítios estéreis em pacientes internados no Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, Rio de Janeiro (RJ) entre 2001 e 2006. MÉTODOS: Durante o período do estudo, 34 isolados de MNT de sítios estéreis de 14 pacientes, a maioria HIV positivos, foram submetidos a identificação fenotípica e hsp65 PCR-restriction enzyme analysis (PRA, análise por enzimas de restrição por PCR do gene hsp65). RESULTADOS: A maioria dos isolados foi identificada como Mycobacterium avium, seguida por M. monacense, M. kansasii e M. abscessus em menores proporções. CONCLUSÕES: A combinação de PRA, um método relativamente simples e de baixo custo, com algumas características fenotípicas pode fornecer a identificação correta de MNT na rotina de laboratórios clínicos.

OBJECTIVE: To identify nontuberculous mycobacteria (NTM) isolated from sterile sites in patients hospitalized between 2001 and 2006 at the Clementino Fraga Filho University Hospital, located in the city of Rio de Janeiro, Brazil. METHODS: During the study period, 34 NTM isolates from sterile sites of 14 patients, most of whom were HIV-positive, were submitted to phenotypic identification and hsp65 PCR-restriction enzyme analysis (PRA). RESULTS: Most isolates were identified as Mycobacterium avium, followed by M. monacense, M. kansasii, and M. abscessus. CONCLUSIONS: The combination of PRA, a relatively simple and inexpensive method, with the evaluation of a few phenotypic characteristics can allow NTM to be accurately identified in the routine of clinical laboratories.

Ocorrência de micobactérias em suínos de abate clandestino no Rio de Janeiro, Brasil / Occurrence of mycobacteria in swine of clandestine slaughter in Rio de Janeiro, Brazil

O estudo das micobactérias atípicas, em especial das que compõem o complexo Mycobaterium avium (MAC), vem crescendo em função de sua associação com diferentes tipos de patologias, principalmente em pacientes imunodeprimidos. Suínos podem atuar como reservatórios destes microorganismos e o exame destes animais em uma região específica permite avaliar a situação epidemiológica das micobacterioses na população humana e das espécies animais. Foram examinados 73 suínos abatidos no ambiente de criação, sem a devida inspeção sanitária. Isolaram-se 21 amostras, sendo sete amostras de crescimento rápido, seis pertencentes MAC e uma Mycobacterium scrofulaceum.Foram ainda identificadas 14 de micobactérias atípicas de crescimento rápido, classificas em M. flavescens (4 amostras), M. chitae (3 amostras), M. peregrinum (2 amostras), M. fortuitum (2 amostras) e M. diernhferi (1 amostra). Consideramos os índices de isolamento vefificados bastante altos, especialmente tendo em vista que esses animais são consumidos diretamente sem qualquer espécie de fiscalização sanitária ou de tratamento prévio dos produtos. Desta forma, consideramos que os animais oriundos de abate cladestino representam importante risco de contaminação ambiental e da população humana exposta a micobactérias em geral e, especialmente, às do MAC.